mNGS技术研讨——探因医学学术交流会圆满结束
发布时间:2021-03-15    浏览:53次    来源: 探因医学

11月30日,由探因医学举办的“mNGS技术研讨学术交流会”在广州中心皇冠假日酒店顺利召开。会议由南方医科大学南方医院佟万成主任担任主席,广州市第八人民医院李粤平主任、南方医科大学南方医院肖冠华主任、中山大学附属第三医院刘静主任、南方医科大学南方医院刘来昱主任带来精彩报告,探讨了mNGS技术在重症领域以及公共卫生感染防控中的应用。


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主题报告

COVID-19重症患者的治疗

李粤平主任首先介绍了新冠疫情的现状,mNGS技术的运用揭示出肺炎疫情与新型冠状病毒有关。当新冠患者出现混合感染时,常规检测技术难以准确快速进行全部病原鉴定,mNGS技术可一次性获得样本中全部微生物,在混合感染的病原鉴定中具有较大的优势。随后介绍了COVID-19重症患者的病理特点和治疗要点,COVID-19患者的病理结果提示有纤维素渗出、弥慢性肺毁损、纤维组织增生、继发支气管粘液增多、血栓形成,并通过实际案例对患者的治疗经过做了详细讲解,针对一位73岁新冠病毒感染患者,给予高流量氧疗,高热时给予小剂量地塞米松,未使用抗病毒药物,低分子肝素治疗一个月后患者病情出现好转。最后李粤平主任介绍了COVID-19重症患者的不同治疗方法和治疗效果,例如抗病毒治疗、氧疗、激素治疗、抗凝治疗、血浆治疗,总结出:“对于重症COVID-19患者,氧疗要趁早,地塞米松可以用,抗凝治疗要做好”。

 

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主题报告

mNGS应用病例分享

肖冠华主任首先分享了一例SLE治疗后发热、呼吸困难的案例,通过回顾这个患者的救治过程,展示了mNGS在免疫缺陷患者诊疗中的应用。接下来介绍了mNGS技术在免疫抑制宿主(ICH)感染诊断中的应用,提到ICH肺部感染的诊治难点包括早期的临床及影像学表现不典型,实验室检查结果不特异;病原学复杂,病原学确诊困难;可用药物多,但治疗思路欠缜密;疗效差且矛盾突出,预后差。基于此现状,他强调mNGS技术具有检测灵敏度高,无偏向性,受抗生素影响小等优势,非常适用于感染早期监测,满足ICH感染防控需求,并通过案例展示了mNGS在免疫缺陷患者诊疗中的应用。最后主任列举了mNGS在急危重感染的应用适应症,包括病情危重需尽快明确病原体;特殊病患者如免疫抑制宿主、合并基础疾病、反复住院的重症感染病需尽快明确病原体;传统微生物检测技术反复阴性且治疗效果不佳等。

 

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主题报告

如何结合二代测序实现病原微生物的精准治疗

刘静主任介绍了宏基因组测序技术的发展历程,列举了mNGS临床应用中常见的问题,包括送检标本如何选择、测序结果如何解读、如何判断污染、定植和致病菌等。她建议送检标本应优选病灶组织,不能盲目选择血标本;由于测序结果受众多因素影响,报告应综合分析;临床上针对病情危重患者、免疫缺陷患者、病因不明患者以及特殊类型病原感染患者,建议通过mNGS来明确感染病原体。最后,主任结合实际案例介绍了mNGS的临床应用,并对样本核酸提取阶段如何去宿主、破壁,生信分析过程如何建立临床监管级别的参比序列数据库等提出了宝贵建议。

 

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讨论环节

会议讨论环节,刘来昱主任就三位讲者的报告作出了精彩的点评,在场的各位专家就mNGS在感染疾病诊断中的具体应用展开了讨论。对于报告解读的问题,刘静主任建议:一定要针对不同样本类型划定reads阳性域值,结合临床判断还是目前mNGS报告解读的关键途径。另外专家们也建议,在进行mNGS时,送检样本的选择是非常重要的,选取与病灶越相关的样本,测得的结果更具有临床意义。


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